Le gouvernement de transition burkinabè a ouvert plusieurs dossiers judiciaires ayant défrayé la chronique et suscité d’intenses passions au pays des hommes intègres. Parmi eux, le dossier Thomas Sankara dans lequel plusieurs personnes ont été inculpées le 22 décembre 2015. La justice militaire a également émis un mandat d’arrêt contre l’ancien président Blaise Compaoré.